Fase F (Kelas XI–XII) Pendidikan Agama Islam memperdalam lima elemen ajaran: Al-Qur'an dan Hadis (musibah, ujian, cinta tanah air, moderasi beragama), Akidah (cabang iman, ilmu kalam), Akhlak (sikap munafik-keras hati, inovatif-etika berorganisasi), Fikih (kewarisan, ijtihad), beserta Sejarah Peradaban Islam (perkembangan di dunia, peran ormas Islam Indonesia).